在气相色谱仪常用的气体净化装置一般包括三种：除水装置、除烃装置和除氧装置，在实际使用中应当根据检测器的类型和实际需要选用合适的气体净化装置。
常用于脱水的物质是变色硅胶和分子筛，通常采用变色硅胶初步脱水，分子筛进一步深度脱水。
气体净化器的功能是用来保证气相色谱仪GC的分析质量和分析结果的稳定性，延长色谱柱寿命和减少检测器的噪声。如变色硅胶变红后失去除水功能，FID氢火焰离子化检测器用于燃烧的氢气中会带有细微的水滴，会对检测器的火焰状态造成影响，出现毛刺、基线噪声大等现象，因此平时应当做好仪器维护，定期老化和更换。